其實，這是對上述兩個文件的誤讀。兩個文件規(guī)定企業(yè)享受優(yōu)惠政策時“不得疊加享受，且一經(jīng)選擇，不得改變”的規(guī)定，是限于企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策與《企業(yè)所得稅法》及其實施條例中規(guī)定的定期減免稅和減低稅率類的稅收優(yōu)惠。而《企業(yè)所得稅法》及其實施條例中規(guī)定的其他各項稅收優(yōu)惠，凡企業(yè)符合規(guī)定條件的，可以同時享受。

例如，2007年底前設立的軟件生產(chǎn)企業(yè)和集成電路生產(chǎn)企業(yè)，經(jīng)認定取得高新技術企業(yè)資格后，就可以享受高新技術企業(yè)的稅收優(yōu)惠。同時按照《財政部、國家稅務總局關于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財稅[2008]1號）的規(guī)定，還可以享受企業(yè)所得稅定期減免稅優(yōu)惠政策。該文件明確，根據(jù)新《企業(yè)所得稅法》的規(guī)定，我國境內(nèi)新辦軟件生產(chǎn)企業(yè)經(jīng)認定后，自獲利年度起，第一年和第二年免征企業(yè)所得稅，第三年至第五年減半征收企業(yè)所得稅。這種情況下，軟件生產(chǎn)企業(yè)“兩免三減半”的優(yōu)惠也應該是新《企業(yè)所得稅法》下的優(yōu)惠。

69號文件第二條第二款規(guī)定：“企業(yè)所得稅法及其實施條例中規(guī)定的各項稅收優(yōu)惠，凡企業(yè)符合規(guī)定條件的，可以同時享受”。也就是說，上述軟件生產(chǎn)企業(yè)和集成電路生產(chǎn)企業(yè)，可以同時享受高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠和企業(yè)所得稅“兩免三減半”的優(yōu)惠。

誤區(qū)四：各項補貼不區(qū)分收入性質(zhì)

由于高新技術企業(yè)受到國家有關部門和各級政府的大力支持，各種名目的補貼往往比較多。例如，各種稅收返還、財政獎勵、技術創(chuàng)新獎勵、專項研發(fā)項目補助等。但很多企業(yè)匯算清算時往往不區(qū)分各項補貼的收入性質(zhì)，誤把應稅收入認為是不征稅收入或免稅收入，把不征稅收認為是免稅收入。

不征稅收入是我國新《企業(yè)所得稅法》中新創(chuàng)設的一個概念，是指從企業(yè)所得稅原理上講應永久不列入征稅收入的范疇。根據(jù)規(guī)定，不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應納稅所得額時扣除；用于支出所形成的資產(chǎn)，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除。

免稅收入是一種稅式支出，其本身已構成應稅收入，但基于稅收優(yōu)惠政策而予以免除。它是國家根據(jù)經(jīng)濟政策目標的需要，在一定時間內(nèi)免予征稅，而在一定時期又可能恢復征稅的收入，其支出允許稅前列支。根據(jù)新《企業(yè)所得稅法》第二十六條規(guī)定，免稅收入分為以下四類：國債利息收入，符合條件的居民企業(yè)之間的股息、紅利等權益性投資收益，在中國境內(nèi)設立機構、場所的非居民企業(yè)從居民企業(yè)取得與該機構、場所有實際聯(lián)系的股息、紅利等權益性投資收益，符合條件的非營利組織的收入等。